嫁接西瓜缺点：

　　(1)尚缺乏对栽培环境适应性较强的砧木品种西瓜属于极不耐连作的蔬菜，不论露地栽培还是保护地栽培，也不论是低温期还是高温期栽培，均需要进行嫁接防病栽培，因此在砧木品种的选择上，往往要根据栽培季节的不同，选择不同类型的砧木品种，尚缺乏既适合于露地栽培也适合于保护地栽培的砧木，也缺乏既耐低温也耐高温的砧木品种。砧木品种的不确定性，一方面影响了西瓜栽培管理技术的稳定性，另一方面也导致了西瓜生产效果的不稳定性。

　　(2)嫁接西瓜的果实品质大多不理想，砧木的品种特性对果实的商品性有很大的影响。虽然目前生产上适合西瓜嫁接育苗的砧木品种数量比较多，但大多数砧木品种是以抗西瓜枯萎病为前提条件入选为西瓜嫁接用砧的，除了抗病性优良外，它们对西瓜果实的品质往往存在着这样或那样的不良影响(常见的有引起果实畸形、空心、果皮加厚、粗纤维增多、异味等)，尚没有不改变西瓜果实原有风味、形状、色泽等的砧木品种，更没有改善上述性状的砧木品种出现，以致目前的嫁接西瓜果实大多商品性状不佳，在外观、果实的剖面性状以及口感等方面，通常很容易与不嫁接西瓜区分开来。它不仅影响了嫁接西瓜的价格，也给人们留下了嫁接西瓜质量差的印象。

　　(3)缺乏适应性广泛的砧木品种西瓜品种由于栽培季节的多样性，栽培面积，栽培习性，种植和其他因素的目的，西瓜品种也多种多样。如：从栽培季节上，分为适合春季栽培的春西瓜品种和适合秋季栽培的秋西瓜品种;从栽培地域上，分为耐干旱的干旱型西瓜品种和喜湿的水瓜型品种;从栽培目的上，分为上市西瓜和贮藏西瓜两类品种;从品种的特性上，又分为普通西瓜、无籽西瓜、四倍体西瓜等品种，等等。不同西瓜品种由于栽培条件不同，对砧木的要求也不同。目前在生产上广泛使用的术语砧木品种，普遍缺乏的品种西瓜砧木品种适应性。“西瓜假生存”经常出现在生产和“果期嫁接西瓜枯萎的植物急”等，通常与使用种类及品种西瓜砧木的适应性较差有关。

　　(4)砧木品种存在枯萎病的潜在危险。目前，在普通西瓜砧木品种中，已发现瓜类砧木复种后易发生枯萎病。经过几次茬口处理，南瓜也出现了枯萎病。

　　(5)瓜农在砧木品种的选择上，缺乏科学指导，盲目性比较严重生产中经常可以发现，多数瓜农在西瓜砧木品种的选择上，大多依赖经验(自己或他人的经验)，较少先做试验，通过试验来确定所用砧木与西瓜品种的配对效果。此外，选择砧木窄幅震荡，大部分西瓜多年来一直不变的砧木品种的选择，种植造成严重的砧木，砧木疫病和疾病的生理事件也呈加重趋势。

　　(6)仍然缺乏适合嫁接育苗的配套生产措施。目前在嫁接西瓜生产中使用的管理措施主要是在不嫁接西瓜的情况下进行复制的，与化肥施用、灌溉和植物调节中使用的砧木没有理想的技术体系。